《中国中医基础医学杂志》创刊于1995年，由国家中医药管理局主管、中国中医科学院中医基础理论研究所主办，是国内目前唯一一本中医基础类专业刊物。
       《中国中医基础医学杂志》主要发表国家自然科学基金、国家社会科学基金、国家中医药管理局科研基金、各省市区及单位的科研基金项目文章。根据学术研究热点、、焦点和发展趋势，坚持立足中医基础理论，兼顾临床基础研究，理论研究与实验研究相结合，基础研究与应用研究相结合的办刊方向，以理论探讨、实验研究和临床基础为主，发表以中医基础理论研究为主的文章。重点栏目有：理论探讨、中医方法学、实验研究、中医多学科研究、临床基础、针灸研究、方药研究、临证验案、述评。
       创刊以来，本刊成为北大中文核心期刊（中国医学类）、中国科技核心期刊、中国科学引文数据库CSCD来源期刊、中国生物学文摘和文献数据库核心期刊、中国学术期刊光盘版核心期刊，被中国学术期刊数据库、中国科技期刊数据库、CA化学文摘(美)、JST日本科学技术振兴机构数据库(日)等数据库收录，在国内外中医基础研究方面具有重要的影响。现任名誉主编为王永炎院士，主编孟庆云，现任社长兼执行主编徐世杰，副主编曹洪欣、吕爱平、潘桂娟、胡镜清。